Umass Dartmouth Dean Vandergheynst致力于全球微生物队的发现努力

来自全球公布资源的研究人员将已知的细菌和古代的已知多样性扩展为44%

U.S. Department of Energy Joint Genome Institute Logo

今天,美国能源联合基因组研究所 宣布 一个新的项目,来自地球微生物群体的基因组,其中拉长了200多名科学家和研究人员的研究,将已知的细菌和古代增加了44%。

其中的研究是mg游戏官网 Dean of the 工程学院 and interim Dean of the School for Marine Science & 技术 Jean VanderGheynst.

尽管在过去十年中排序技术和计算方法进行了进展,但研究人员已经发现了仅仅是地球的微生物多样性的一小部分的基因组。由于大多数微生物不能在实验室条件下培养,因此不能使用传统方法进行测序。识别和表征地球的微生物多样性是了解微生物在调节营养周期中的作用的关键,以及对其在各种研究领域中可能拥有的潜在应用的见解。

从世界各地的环境样本产生的52,515个微生物草案的公共储存库,现在可获得44%的已知细菌和古代的细菌和古代的多样性。 自然生物技术。被称为宝石(来自地球的Microciomes的基因组)目录,这项工作由美国美国研究人员涉及超过200个科学家的合作产生的合作。能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI),位于劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)的DOE科学用户设施办事处,以及DOE系统生物学知识库(KBase)。

Vandergheynst的贡献与她在堆肥微生物体中发现工业酶的研究有关,以将植物生物质转化为生物燃料。 

Dean Jean VanderGheynst headshot

Metagenomics是使用各种方法进行处理,测序和分析的各种方法来研究环境样品中的微生物群落的研究。 “使用一种称为Metagenome Binning的技术,我们能够直接从测序的环境样品重建数千种组装的基因组(嘛GS),而不需要在实验室中培养微生物,”注意到 斯蒂芬Nayfach.,该研究的第一作者和尼科斯·克罗佩斯的微生物组数据科学集团的作者和研究科学家。 “这项研究真正脱颖而出的是我们分析的样本的显着环境多样性。” 

Emiley Eleo-Fadrosh,JGI Metagenome计划负责人和高级作者mg游戏官网Nayfach的评论阐述。 “本研究旨在包括最广泛,最多样化的样品和环境,包括自然和农业土壤,人类和动物宿主相关的和海洋和其他水生环境 - 这非常出色。”



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